Valami bűzlik Coruscantban… A Köztársaság-hű Naboo bolygó uralkodója, Amidala királynő nagy bajban van, s a Szenátus tehetetlen. A Kereskedelmi szövetség hajóival blokád alá veszi a bolygót, túszul ejti a békés nép uralkodóját s kormányának tagjait. Követelésük: Naboo fizessen adót minden kereskedelmi tevékenysége után. Amidala már csak a két jediben Qui-Gonn Jinn-ben és tanítványában, Obi-Wan Kenobi – ban bízhat. A béke őrei azért érkeznek, hogy tárgyaljanak a blokádról a kereskedelmi szövetség agresszoraival.

  Az erősen politikára  hangolt kezdés mintegy 40 évvel visz minket vissza a legendás 1977-es Csillagok háborúja cselekményéhez képest. George Lucas , a bolygóközi mese szellemi atyjának álma 1999-vált valóra, amikor végre belekezdhetett története befejezésébe – vagy befejezte a kezdeteket? A kezdeteket, ahol a gonosz Birodalom még nem létezik, csupán egy rejtélyes, csuklyás és igen ragyás sith nagyúr ármánykodik, ahol a jedik egész serege őrzi a békét, ahol az Erő még elevenen vibrál, és Yoda számára is kifürkészhető. De a vég már elkezdődött, a Kereskedelmi szövetség a gyámoltalan naboo-iakra támad, a Szenátus hatalma gyengül, és sürgősen kell valaki, aki egyensúlyt teremt az Erőben.

 Qui-Gonn Jinn mester és tanítványa, Obi-Wan Kenobi kiszabadítja a naboo-ról túszul ejtett Amidalát, és lopott űrhajójukon menekülőre fogják a dolgot.  A blokád áttörésekor megsérült hajóval azonban nem jutnak messze, leszállnak a kietlen, sivatagos Tatuinon, hogy a javításhoz alkatrészeket szerezzenek. Qui-Gonn és Obi-Wan igazi jedihez méltó flegmával sétál be Mos Eisleyba, hogy aztán elkövessék a filmdráma első vétségét – rátalálnak Anakin Skywalker – re. A második, immár helyrehozhatatlan vétség az, hogy el is hozzák az akkor 12 éves gyereket, és ezzel világra szabadítják Darth Vadert.

  Közben a kereskedelmi szövetség átfogó robottámadást indít a naboo ellen, ahol az Amidala népével szimbiózisban élő, ám nem kevésbé békaszerű gunganok hiába „ épite védepajzs”, hogy egyedi szóhasználatukkal éljenek. A bolygót, és a békét végül – ha átmenetileg is – Qui – Gonn és Obi-Wan maroknyi csapata és az egyesített gungan haderő védi meg,amibe a jedi mester belehal, viszont tanítvány Kenobi megörökli Anakin Skywalkert, hogy a következő két részben felnevelje, kiképezze, majd végignézze bukását, és kénytelenkelletten átengedje a sötét oldalnak.